多肽固相合成法的主要特征是无需纯化中间产物，能够持续开展合成过程，从而为多肽合成的自动化技术打下了坚实基础，是多肽合成化学中的一个巨大的进步。现阶段自动式多肽的合成，基本上都是固相合成。其大致流程如下所述：

根据Fmoc化学合成，先将要合成的任务多肽的C-端氨基酸的羧基以共价键模式与一个不溶性的高分子树脂连在一起，并且以这个氨基酸的氨基当做多肽合成起始点，同其余的氨基酸早已活化的羧基作用产生肽键，反复重复这个过程，就可以获得多肽。按照多肽的氨基酸组成差异，多肽后处理方式不同，纯化方法也有所差异。

1、多长的多肽比较适合做免疫使用?

通常约10-15个氨基酸，不过长一点免疫效果更好，但是合成花销也会提高。MAP多肽则期望长度在15aa之上，效果比较好。其次，10aa以内的多肽免疫效果差一些。

2、免疫用多肽的纯度必须很高吗?

通常情况下，免疫用Peptide，70-85%就可以了。

3、人们合成的多肽溶解能力欠佳，多肽就不行对不对?

难以精确预估一个多肽的溶解度及适宜的溶剂有哪些。倘若多肽很难溶解就认定多肽合成有问题这种想法并不合理。

4、非HPLC纯化的多肽中都有哪些杂质?

粗品和脱盐等级的多肽中多肽和非多肽类杂质：如非全长多肽和多肽后处理的部分原料如DTT、TFA等。

5、HPLC纯化的多肽都有哪些杂质?

通过HPLC纯化的多肽，仍可能会有一些部分杂质产生，这里面的杂质通常是短肽和微量TFA。