萃取法

上世纪五六十年代，世界上包括中国在内的许多国家主要从动物器官中提取多肽。例如，将新生犊牛宰杀，取下其胸腺，然后用震荡分离生物技术从犊牛胸腺中分离出肽，制备胸腺肽注射液。这种胸腺素被广泛用于调节和增强人体的细胞免疫功能。

天然生物活性肽分布广泛，自然界中动物、植物和海洋生物中存在着丰富的生物活性肽，发挥着多种生理功能，维持着正常的生命活动。这些天然生物活性肽包括抗生素、激素等生物的次生代谢产物，以及存在于各种组织系统中的生物活性肽。

目前，已从人、动物、植物、微生物和海洋生物中分离出许多生物活性肽。然而，生物活性肽在生物体内的含量普遍较低，目前从天然生物中分离纯化生物活性肽的技术尚不完善，成本高，生物活性低。

常用的多肽提取分离方法有盐析、超滤、凝胶过滤、等电点沉淀、离子交换层析、亲和层析、吸附层析、凝胶电泳等。其主要缺点是操作复杂、成本高。

酸碱法

酸水解和碱水解多用于实验机构，但在生产实践中很少使用。蛋白质在碱性水解过程中，大部分氨基酸如丝氨酸、苏氨酸被破坏，发生外消旋，大量营养物质流失。因此，这种方法在生产中很少使用。蛋白质的酸水解不会引起氨基酸的外消旋，水解速度快，反应完全。但其缺点是工艺复杂、控制困难、环境污染严重。肽的分子量分布不均匀且不稳定，其生理功能难以确定。

酶水解

大多数生物活性肽存在于蛋白质的长链中，处于非活性状态。当被一种特定的蛋白酶水解时，它们的活性肽从蛋白质的氨基序列中释放出来。酶法从动、植物和海洋生物中提取生物活性肽是近几十年来的研究热点。

酶法水解生物活性肽是选择合适的蛋白酶，以蛋白质为底物，水解蛋白质，获得大量具有多种生理功能的生物活性肽。在生产过程中，温度、PH值、酶浓度、底物浓度等因素与小肽酶解效果密切相关，关键是酶的选择。由于酶解所用的酶不同，酶的选择和配方不同，蛋白质来源不同，得到的多肽的质量、分子量分布和氨基酸组成也有很大差异。人们通常选择动物蛋白酶，如胃蛋白酶和胰蛋白酶，以及植物蛋白酶，如菠萝蛋白酶和木瓜蛋白酶。随着科学技术的发展和生物酶技术的不断创新，将会有越来越多的酶被不断发现和利用。酶解技术成熟，投资低，在生物活性肽的制备中得到了广泛的应用。